Unidad de Espectrometría de Masa

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Personal

Equipamiento

  • Espectrómetro de masa Q Exactive HF (analizador Orbitrap High Field, Thermo Scientific)
  • nanoHPLC Ultimate3000, con sistema de inyección automatizada.
  • Protean II (geles 2D de 20×20 cm)
  • Computadoras de alta performance para análisis de datos.

Servicios

Todos los servicios se realizan previa consulta con la unidad y la posterior solicitud de turnos en el Sistema Nacional de Espectrometría de Masa, al cual se encuentra integrada esta Unidad. En
los documentos disponibles se detallan los procedimientos a seguir (Link de documentos).

  • Identificación de proteínas de organismos con proteomas disponibles en bases de datos de dominio público.
  • Análisis de cuantificación relativa (LFQ, Label-Free Quantitation).
  • Estudios de modificaciones post-traduccionales (consultar).
  • Identificación de proteínas de spots de geles monodimensionales y bidimensionales.
  • Identificaciones de proteínas heterólogas y mutaciones en muestras complejas.

Otros servicios de la Unidad

  • Entrenamiento básico de programas de análisis de datos proteómicos
  • Purificación de muestras por gel de poliacrilamida
  • Análisis detallado de datos
  • Preparación especial de muestras complejas
  • Asesoramiento sobre planificación y diseño de proyectos proteómicos

Tarifas

Tarifas UEM-IBR – valores en dólares
Investigadores(1) Empresas IBR consorcio
Corrida única (gradiente de 120 min) (2) 65 150 50
Corrida única (gradiente de 75 min) (2) 55 120 40
Cuadruplicado LFQ (3) 240 530 170
Inyección directa/h 40 90 30
Entrenamiento básico MaxQuant/Perseus 55 120
Informe standard (4) 40
Gel de poliacrilamida (5) 50 110 35
Análisis detallado de datos (6) por hora de trabajo 40 85 consultar

 

Se facturará en pesos argentinos, se convierte al cambio oficial el día que se genera la factura.
(1) Indica el precio para investigadores de organismo públicos o de instituciones sin fines de lucro no pertenecientes al IBR
(2) En base a la consideración de la complejidad de la muestra y los análisis requeridos la UEM definirá previamente el tipo de corrida necesaria.
(3) Valor por el conjunto de cuatro muestras. Se aconseja proveer de cuadruplicados para este tipo de estudios. No se correrán muestras en las que se reciban duplicados solamente.
(4) Todos los estudios se entregarán con los datos originales (.RAW) y con un análisis básico de identificación peptídica, y cuando sea apropiado un “volcano plot”.
(5) Puede solicitarse al servicio la purificación de muestras necesaria para las digestiones proteolíticas. Costo para cada grupo de entre 1 a cuatro muestras. Para el envío de cortes de gel realizados en el laboratorio de origen consultar el “Protocolo para la purificación de muestras por geles de poliacrilamida” cuyo link se ofrece más abajo, o contáctese con el servicio por los canales provistos para obtener más información.
(6) Para obtener estudios detallados de datos e interpretación de resultados, como así también el diseño de experimentos no listados en los servicios ofrecidos por la UEM, contactarse por los canales previstos para una entrevista de evaluación del trabajo y así obtener un presupuesto estimativo.

Envío de muestras

1) Contáctenos previamente (uem_ibr@ibr-conicet.gov.ar): Le informaremos si podemos realizar el análisis que usted necesita y las condiciones generales para la recepción y procesamiento de muestras, conjuntamente con el costo total del estudio.

2) Obtenga un turno en el SNEM siguiendo el instructivo:

SOLICITUD DE TURNOS PARA LA UEM

3) Complete el formulario de envío de muestras siguiendo el instructivo. Provea la máxima información posible.

Formulario Muestras UEM IBR

4) Para enviar muestras en geles de acrilamida, siga el siguiente instructivo:

Preparación de muestras por SDS-PAGE

Instructivo para evitar contaminaciones

5) Envíe las muestras: Adjunte el formulario y avise por mail que las ha enviado.

Cursos

  • Diciembre de 2021

“Unveiling biological networks by cutting-edge proteomics tools”

El staff de la UEM junto a otros expertos brindamos un curso internacional presencial sobre interactómica donde participaron 26 estudiantes provenientes de 6 países latinoamericanos. Las clases teóricas fueron grabadas y están disponibles en YouTube.

Contacto

E-mail: uem_ibr@ibr-conicet.gov.ar

Unidad de Espectrometría de Masa
Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario
Esmeralda y Ocampo,  (2000) Rosario, Argentina