Estructura, plegamiento y función de proteínas

Proyecto: DESENTRAÑANDO EL SISTEMA Clp: REGULACIÓN DE LA PROTEÓLISIS Y SU IMPACTO EN LA FISIOLOGÍA BACTERIANA

Descripción: En bacterias y algunas organelas de eucariotas la proteasa Clp es particularmente abundante. El complejo multiproteico de 1 Megadalton, compuesto por la proteasa ClpP y el chaperón ClpA, reconoce y degrada proteínas con regiones hidrofóbicas expuestas. La especificidad de ClpAP aumenta significativamente cuando se asocia con proteínas adaptadoras como ClpS, que reconoce degrones N-terminales y facilita la entrega de sustratos a ClpAP.

Hasta hace pocos años, se conocían solo dos sustratos específicos de ClpS en Escherichia coli y se desconocía su importancia fisiológica. Investigaciones recientes en Salmonella enterica revelaron que ClpS se asocia con reguladores que modifican su interacción con ciertos sustratos, actuando como “anti-adaptadores” y determinando la virulencia, el estado nutricional y la resistencia a antibióticos de la bacteria. Estos hallazgos conectan la función del complejo ClpAPS con la fisiología celular más allá de su rol proteolítico general.

Estos descubrimientos han abierto un nuevo campo de estudio en la regulación de complejos proteolíticos bacterianos, implicando la identificación del interactoma y el repertorio completo de sustratos de ClpAPS. Sin embargo, la investigación enfrenta el desafío de la cinética rápida y la baja afinidad de los interactores y sustratos con el complejo ClpAPS, lo que requiere técnicas avanzadas como el marcaje por proximidad seguido de espectrometría de masa de alta resolución y el entrecruzamiento químico, áreas en las que el grupo de investigación es experto.

El objetivo general de nuestras investigaciones es revelar el interactoma y el repertorio de sustratos del complejo ClpAPS por marcaje por proximidad y estudiar como influyen sobre la fisiología celular. A tal fin, utilizaremos metodologías de última generación disponibles en el IBR, como espectrometría masa Orbitrap de alta resolución.

Perfil del postulante: Doctor/a en carreras afines a la ciencias biológicas

Director: Germán Rosano

Convocatoria Conicet 2024

Contacto y más información: rosano@ibr-conicet.gov.ar