Tema: Identificación de variaciones genéticas en cuádruplex de guanina como posible causa de alteraciones de la expresión génica en patologías humanas.
En el laboratorio estudiamos una novedosa estructura de los ácidos nucleicos (del ADN y del ARN) diferente a la conocida doble hélice: los cuádruplex de G o G4. Los G4 son estructuras que de forma transitoria o estable pueden formarse en diferentes regiones del ADN o ARN de las células e influir sobre la expresión de los genes. En este proyecto, estudiaremos cómo la formación de G4 puede estar relacionada con la expresión de genes vinculados con diferentes enfermedades humanas como el cáncer, enfermedades neurodegenerativas y otras patologías con componentes de predisposición genética. Para esto, vamos a estudiar de qué manera las variaciones genéticas que existen entre diferentes individuos pueden afectar la formación de estructuras G4, contribuyendo a la expresión génica diferencial entre individuos y a la predisposición al desarrollo de patologías. Resultados previos de nuestro laboratorio revelaron la existencia de variaciones genéticas en regiones reguladoras de la expresión de un grupo de oncogenes y de otros genes relacionados con patologías humanas, que presentan la capacidad de regular la transcripción o traducción. El proyecto implica un amplio análisis bioinformático para generar una base de datos de las variaciones genéticas asociadas a enfermedades humanas con posible influencia en la formación de G4 (principalmente en la traducción). También se plantea la realización de experimentos para comprobar in vitro algunas de las predicciones bioinformáticas del efecto sobre la formación de G4 (empleando técnicas espectroscópicas, ensayos bioquímicos y RMN). Finalmente se estudiarán los efectos de las variaciones genéticas identificadas sobre la regulación de la expresión génica utilizando el contexto celular mediante el uso de cultivos celulares. Con este proyecto, se espera generar un marco teórico-experimental para la utilización de las variaciones genéticas identificadas como potenciales marcadores de susceptibilidad al desarrollo de patologías humanas y/o como blancos terapéuticos para el diseño de fármacos.
Los cuádruplex de guanina (G4) son estructuras alternativas de los ácidos nucleicos que se forman en regiones ricas en guanina y han sido descriptas como elementos moduladores de la expresión génica.
Investigador responsable: Dr. Pablo Armas.
Fecha de inicio: marzo o abril de 2022
Lugar de trabajo:
Instituto Biología Molecular y Celular de Rosario (IBR) – CONICET-Rosario.
Beca doctoral para realizar el Doctorado en Ciencias Biológicas en FCByF – UNR.
Requisitos de los postulantes:
Para beca doctoral:
Graduado o estudiante próximo a graduarse (recibido para 15 de marzo de 2022) de Licenciatura en Biotecnología, Licenciatura en Genética, Licenciatura en Biología, Licenciatura en Biología Molecular, Bioquímica o carreras afines.
Para mayor información ver requisitos en ANPCyT:
http://www.agencia.mincyt.gob.ar/frontend/agencia/post/712
Contacto:
Enviar e-mail, adjuntando CV completo con los antecedentes relevantes y breve nota de presentación describiendo sus intereses y experiencia anterior, así como los datos de contacto, a la siguiente dirección: armas@ibr-conicet.gov.ar.
Recepción de postulaciones: hasta el 16 de Marzo de 2022.
Publicaciones de referencia:
– Bezzi, G.; Piga, E.J.; Binolfi, A.; Armas, P. (2021). “CNBP binds and unfolds in vitro G-quadruplexes formed in the SARS-CoV-2 positive and negative genome strands”. Int. J. Mol. Sci. 22(5): 2614. DOI: 10.3390/ijms22052614
– David, A. P.; Pipier, A.; Pascutti, F.; Binolfi, A.; Weiner, A.M.J.; Challier, E.; Heckel, S.; Calsou, P.; Gomez, D.; Calcaterra, N.B.; Armas, P. (2019). “CNBP controls transcription by unfolding DNA G- quadruplex structures”. Nucleic Acids Res. pii: gkz527. DOI: 10.1093/nar/gkz527.
– Armas, P.; Calcaterra, N.B. (2018). “G-quadruplex in animal development: contribution to gene expression and genomic heterogeneity”. Mechanisms of Development. 154: 64-72. DOI: 10.1016/j.mod.2018.05.004
– Armas, P.; David, A.P.; Calcaterra, N.B. (2017). “Transcriptional control by G-quadruplexes: in vivo roles and perspectives for specific intervention”. Transcription 8(1): 21-25. DOI: 10.1080/21541264.2016.1243505
– David, A.P.; Margarit, E.; Domizi, P.; Banchio, C. E.; Armas, P.* (Co-corresponding author); Calcaterra, N.B.* (2016). “G-quadruplexes as novel cis-elements controlling transcription during embryonic development”. Nucleic Acids Res. 44(9): 4163–4173. DOI: 10.1093/nar/gkw011
Más información:
https://www.ibr-conicet.gov.ar/personal/armas-pablo https://www.ibr-conicet.gov.ar/noticias/demuestran-funciones-regulatorias-de-nuevas-formas-del- adn/
http://atlasofscience.org/g-quadruplexes-novel-dna-structures-controlling-life-from-the- beginning/
