Fecha de inicio: diciembre 2019 – febrero 2020 Tema: Estudio de las funciones de los cuádruplex de guanina como moduladores de múltiples pasos de la expresión génica durante el desarrollo embrionario. PICT IA – Convocatoria 2017 El desarrollo embrionario animal comienza con una única célula pluripotente que se multiplica activamente para generar linajes celulares con múltiples destinos de diferenciación, contrastando con la proliferación descontrolada observada en células tumorales. El proceso controlado del desarrollo depende del estricto control espacio-temporal de la expresión génica, el cual es conservado entre vertebrados existiendo familias de genes que controlan la formación de diferentes tejidos, órganos y patrones corporales. Esto incentiva el uso de modelos animales de laboratorio para su estudio. Dicho control involucra elementos reguladores del ADN (a nivel transcripcional) y del ARN (a nivel post-trasncripcional), y proteínas de unión a éstos elementos. Existen cada vez más evidencias de que las estructuras no canónicas del ADN (estructuras no-B), cumplen funciones en la regulación de la expresión génica. Un claro ejemplo son los cuádruplex de guanina (G4), estructuras de cuatro hebras ricas en guanina estabilizadas por la interacción lateral entre 4 guaninas que forman 2 o más planos apilados. Los G4 han adquirido gran relevancia como elementos reguladores de la expresión transcripcional y post-transcripcional de genes relacionados con el control de la proliferación celular e involucrados en el cáncer. Si bien existen sobradas evidencias in silico e in vitro de las funciones de los G4, son menos numerosos los trabajos que demuestran sus funciones en el contexto celular y muy escasos los que abordan el estudio funcional in vivo. El aporte previo de nuestro grupo ha sido la principal evidencia de la participación de los G4 en la regulación transcripcional in vivo en embriones de pez cebra, posicionando al desarrollo embrionario como como paradigma para el estudio de la función regulatoria de los G4 en un proceso biológico complejo y altamente dependiente de la regulación de la expresión génica. En vista de esto, el principal objetivo de este proyecto es identificar procesos de regulación génica relevantes para el desarrollo de embrionario que dependan de la formación de G4 para luego evaluar su relevancia in vivo. Para lograr este objetivo se proponen las estrategias para profundizar los conocimientos sobre la función de los G4 y de proteínas reguladoras de su formación en el control transcripcional de genes relevantes para el desarrollo embrionario. Además, se plantea la identificación in silico e in vitro de secuencias de ARN con potencial de formar G4 (PG4) en regiones reguladoras de la expresión génica a nivel posttranscripcional, conservadas entre organismos vertebrados y con posibles funciones en el desarrollo embrionario, para evaluar su función regulatoria in cellulo e in vivo. Publicaciones de referencia: – David, A. P.; Pipier, A.; Pascutti, F.; Binolfi, A.; Weiner, A.M.J.; Challier, E.; Heckel, S.; Calsou, P.; Gomez, D.; Calcaterra, N.B.; Armas, P. (2019). “CNBP controls transcription by unfolding DNA Gquadruplex structures”. Nucleic Acids Res. pii: gkz527. doi: 10.1093/nar/gkz527. – Armas, P.; Calcaterra, N.B. (2018). “G-quadruplex in animal development: contribution to gene expression and genomic heterogeneity”. Mechanisms of Development. 154: 64-72. https://doi.org/10.1016/j.mod.2018.05.004 – Armas, P.; David, A.P.; Calcaterra, N.B. (2017). “Transcriptional control by G-quadruplexes: in vivo roles and perspectives for specific intervention”. Transcription 8(1): 21-25. DOI: 10.1080/21541264.2016.1243505 – David, A.P.; Margarit, E.; Domizi, P.; Banchio, C. E.; Armas, P.* (Co-corresponding author); Calcaterra, N.B.* (2016). “G-quadruplexes as novel cis-elements controlling transcription during embryonic development”. Nucleic Acids Res. 44(9): 4163–4173. DOI: 10.1093/nar/gkw011
Más información:
https://www.ibr-conicet.gov.ar/noticias/demuestran-funciones-regulatorias-de-nuevas-formas-del-adn/
G-quadruplexes: novel DNA structures controlling life from the beginning
Investigador responsable: Dr. Pablo Armas.
Lugar de trabajo:
Instituto Biología Molecular y Celular de Rosario (IBR) – CONICET-Rosario.
Beca doctoral para realizar el Doctorado en Ciencias Biológicas en FCByF – UNR.
Requisitos de los postulantes:
Para beca doctoral:
A
B
Graduado o estudiante próximo a recibirse (recibido para diciembre 2019-febrero 2020) de Licenciatura en Biotecnología, Licenciatura en Genética, Licenciatura en Biología, Licenciatura en Biología Molecular, Bioquímica o carreras afines.
Para beca post-doctoral:
Doctorado en Ciencias Biológicas o similar, terminado o en etapas finales (doctorado para diciembre 2019-febrero 2020).
Para mayor información ver requisitos en ANPCyT: http://www.agencia.mincyt.gob.ar/frontend/agencia/post/712
Contacto:
Enviar e-mail, adjuntando CV completo con los antecedentes relevantes y breve carta de presentación describiendo sus intereses y experiencia anterior, así como los datos de contacto, a la siguiente dirección: armas@ibr-conicet.gov.ar.
